Если все линии pci-у заняты, но не все подключенные устройства в данный момент времени задействованы в работе деление линий всё равно будет или же это происходит в момент работы устройств?
На десктопных материнках инициализация PCI-E устройств происходит только в момент включения компа. И даже серверы не все умеют в PCI-E Hotswap. И нет никакого деления линий от степени "задействованности" устройств.