Как узнать, нет проблем с контроллером флешки. Файл не жалко. Важно состояние флешки.
С контроллером проблем нет - иначе ничего бы не открывалось, да и флешка не определялась бы.
А вот с флеш-памятью, скорее всего, некоторые проблемы имеются.
Так что просто удали/перезапиши этот проблемный файл...