Вот теперь стало понятно что всего было три девайса.
Лог сканирования готов? По данным из зеркала, MFT была одним фрагментом (позже обьясню как смотреть), так что, если просканировалось на разделе хотя бы 7100000 секторов, то можно выложить промежуточный лог.
Ну и ещё, не стесняясь расскажи о какой версии HDDclone идёт речь? Версия и откуда взята. Пока не понятно в чём причина, но для статистики эти данные пригодятся.
А то вон есть проблемы после использования одной, вполне нормальной программы, а как выяснилось проблемы происходят с суперэнтерпрайз версии с торрентов.
Добавлено через 3 минуты
И ещё один момент. Судя по всему, при сбое, винда могла сдампить что то (содержимое памяти или ещё чего то) на зону MFT. Но не факт что и ещё куда то.
Так что, даже если получится восстановить нужное тебе, не факт что оно будет целым. Это, как и многое другое явно говорят о том, что бэкапиться надо.