В Root структура данных показывается
Ок. И хотя это уже нормально, но если быть точным, то это означает лишь что индексы целы.

Можно сделать еще виртуальную реконструкцию и если всё останется на месте, то и с остальными метаданными всё в порядке.
Собственно что дальше?
Если в виртуальной реконструкции снимешь чекбокс показа удалённых, то увидишь то, как видит проводник винды. То есть, нет уже всяких "мусорных" файлов. Можно их восстанавливать, хотя ты вроде как уже и из полного скана восстановил нужное. Опять же - в случае что не так пойдёт, есть посекторка.
Восстановление файловой системы по месту. В патче отсутствует 2-я запись и данные о битовой карте MFT - это не ошибка а просто не имеет смысла поиск
того где это на диске. Это в дальнейшем "отшлифует" чекдиск - вопрос в том есть ли ещё какие то ошибки. Поэтому, назначаешь тому букву и делаешь проверку чекдиском в режиме только чтения. Смотришь что пишется в логе (показываешь скриншот или текстовый файл) - исходя из того что там будет, принимается решение о разрешении исправления ошибок.