Забить на это дело? Я просто боюсь что это то какой то трабл с матерью.
Если прямо сильно надо USB 3.0 можно внешний контроллер купить, но не думаю, что из-за 1-го устройства это стоит делать, тем более, что тот HDD должен работать с обычными USB 2 портами (по крайней мере с "двойным" шнуром).
Однако, стоило бы его (жесткий диск) на другом ПК проверить, мало ли, может проблема в нем.