Шина САТА, подозреваю, тоже не напрямую к процу подключена

Другое дело, что врядли это отразится на единичных видеокартах - уже давно писалось, что вставка карты в более старый слот PCIE с режимом предыдущего поколения сама по себе практически не отражается на производительности