Я так понял што файл AFUDOS.EXE надо переименовать на AFLASH.EXE..?
Не надо переименовывать, там опечатка.
А строку afudos /i For example, afudos/ надо набирать без изменений.
В Вашем случае должно быть
afudos /iM2N.rom, где
M2N.rom - это файл желаемой прошивки.