Формотни диск в NTFS с размером кластера 4k. что это такое и как это сделать читай тут
http://www.3dnews.ru/reviews/softwar.../index02.htm#7
А дифрагментатор и родной виндосовский не плохо справляется. Но вообще а рекомендую VoptXp, маленький, но работает отлично. вот ссылка
http://lw.by.ru/arsenal/vopt_xp.shtml